飲食店を経営している法人です。商品の持ち帰りの際に容器代を別途いただいていますがこの容器代は軽減税率の対象となるのでしょうか。

飲食料品の販売時に使用される容器については通常必要なものとして使用される場合はその容器も含めて軽減税率の対象となります。
通常必要なものとは持ち帰った飲食料品が消費された場合などに不要になるものをいいます。
なお、贈答用の包装資材などで別途価格を決めているものは軽減税率の対象となりません。