1年前に当社の役員が入れ替わった際に役員変更登記を忘れており1年遅れで登記したところ地方裁判所から過料の支払いを命じられました。 このとき支払う過料は損金に算入することが出来ますか?

法人の変更登記を期間内に行わなかった際に科せられる過料の支払いは代表者本人に対して通知されるものになります。
従って、法人税法上の損金にもならず会計上の経費ともなりません。
尚、過料は刑事罰ではなく行政罰である為、代表者に前科はつきません。