私はNISA口座と通常の証券口座の2つを持って株式取引を行っています。今年はそれぞれの口座で株式売買を行ったところNISA口座では50万円の損失が生じ、通常の証券口座で50万円の利益が生じました。 この2つの口座間で損益通算は可能でしょうか?

損益通算は不可能です。NISA口座には、株式売買益や配当金には課税されないメリットがありますが、損失が生じた場合に他の口座との損益通算は出来ません。
また、損失を翌年に繰り越して翌年の利益と相殺する事も出来ません。