個人事業主です。妻に青色事業専従者として専従者給与を支払っていますが、大学生の息子にも手伝ってもらっている為給与を支払いたいと 考えております。制度上問題はありませんか?

青色専従者給与は事業に専念している配偶者や親族に対して支払う給与となり、基本的には学生の身分の者に対して支給しても必要経費としては認められにくいでしょう。